1990ndad olid superkangelaste koomiksite jaoks tormiline aeg. Tööstus nägi tarbijates enneolematut buumi, millele järgnes kiiresti lõualuu langus. Sellised kirjastajad nagu Valiant tõusid 90ndatel kiiresti tuntuse juurde, enne kui nad müüdi maha teistele ettevõtetele, kes pärast koomiksiõnnetust lõpuks pankrotti läksid (enne kui nad lõpuks taas üles tõsteti nagu fööniks 2000. aastate keskel). Isegi koomiksiraamatute titaanid DC ja Marvel nägid suurt vaeva, mis pani kirjastajad võtma lugejaid lugemiseks drastilisi (ja kohati ka nõmedaid) abinõusid, nimelt tappes kuldsed ja hõbedased kangelased ning asendades need uutega.
Mitmete koomiksimaailma tuntumate kunstnike, nagu Jim Lee ja Todd McFarlane, 1992. aastal Image Comics moodustamine oli väga seotud superkangelaste raamatute ümberkujundamisega. Image avaldas kiiresti loojatele kuuluvate tegelaste panteoni, mis tõukas tööstuse piire koomiksitega nagu õudusteemaline Spawn ja sürrealistlik superkangelasari The Maxx. Rokkstaari kunstnikud müüsid miljonites koomiksit ja edu laine viis suure väljaandjate nägemiseni igal võimalusel dollarimärke. Varem oli superkangelaste koomiksiturg üleküllastatud spetsiaalsete holograafiliste teemadega ja illustraatorid väsitasid variantide kaante väntamist.
Maksimaalse kasumlikkusega mentaliteet levis kiiresti üldsusele, kes pidas koomiksite kogumist kiireks ja lihtsaks investeeringuks. Kuid kui kollektsionääridele anti karm tõde, et nende väljaandmine X-Menist nr 1 Jim Lee libeda Magneto kattega ei plaaninud nende hüpoteeki maksta, ja turg varises peaaegu kohe kokku. Pärast seda, kui superkangelaste turg muutis veelgi täiuslikumaks uute tegelaskujude hulga, tegid Marvel ja DC oma klassikaliste kangelastega drastilisi muudatusi, et hoida neid asjakohastena.
Võib olla raske ette kujutada maailma, kus Marvel Comics on uppumas pankrotti, kuid 1996. aastal juhtus see täpselt. Vaid kaks aastat enne seda avaldas Marvel Spider-Mani mütos musta silmaga kloonisagara, kus Peter Parker asendati New Yorgi lemmikveebis tema veste kandva klooni Ben Reillyga, kes oli AKA Scarlet Spider.
Lugu oli jätk 1970ndate alguse süžeele, mis hõlmas Ämblikmeest ja tema surnud sõbrannat Gwen Staceyt ning kelle kloonib peagi supervisioonist pärit Miles Warren, AKA, Jackal. Kirjanik Gerry Conway jättis tahtmatult lõpu mitmetähenduslikuks, mille tõttu lugu taaselustati 90ndatel ja Peter Parker asendati tema klooniga. Nii fännide kui ka Marveli enda loominguliste töötajate avalik väljapressimine kloonsaaga üle kajab tänapäevani. Kui lugu lõpuks mässiti, oli Marvel juba rahalises hävis. Nende ühe lipulaeva tegelase väljavahetamine oli katse šokeerida Spider-Mani veebis uut elu, kuid see osutus ühe kirjastuse kõigi aegade vihatuimate lugude hulka.
Kuid Scarlet Spider on vaevalt ainus nutikas superkangelase asendaja Marvel, kes loodi 90ndatel. Teises pilkupüüdvas lookaares pealkirjaga Ristumine muutis Raudmees kurjaks, suri ja tema asemele tuli teismelise mina. Teismeline Stark oli igati sama trotslik kui tema vanem koomiksiraamatukaaslane, kuid lisandunud 90-ndate rämeda suhtumisega. Õnneks kestis see Raudmehe versioon ainult 8 numbrit. Tuleb märkida, et kuigi mõnel Marvel Comicsi kangelasvahetusel - näiteks Scott Lang asendas Hank Pymit Ant-Manina 1979. aastal - oli pikk ametiaeg, kuid paljud neist olid lühiajalised.
Kuid mitte kõik Marveli taaskäivitatud kangelased polnud rahaline ebaõnnestumine. 90-ndate aastate jooksul kortsutasid Avengers ja Fantastic 4 koomiksit ning püüdsid oma müüginumbreid elustada kunstnikud Jim Lee ja Rob Liefeld saatsid Avengersi ja FF-i liikmed taskuuniversumi ning vahetasid nad välja nooremate tegelastega. Kirjastuse Heroes Reborn tiitlid said enamasti positiivseid ülevaateid ja olid muidu hädas olevale ettevõttele ajutiseks eduks.
DC suutis 90ndate tormi konkurentidest paremini üle elada, kuid kirjastaja nägi kõvasti vaeva, et kõige peal püsida. Müügi suurendamiseks tappis DC 1993. aastal ära nende vanima ja äratuntavaima tegelase Supermani. Vaid 3 kuud pärast saatuslikku lahingut Doomsday nime kandva maailmahävitava koletisega taasavati kõik DC DC Supermani tiitlid, igaüks neist asendava Supermaniga. —Superboy, Steel, Cyborg Superman ja Eradicator. Supermani surmakaare surm oli selline nähtus, et seda ei kajastanud mitte ainult peavoolumeedia, vaid Saturday Night Live tegi sellest oma 18. hooajal isegi paroodia visandi.
Küünikud väitsid, et Man of Steel'i surm ei oleks püsiv ja neil oli õigus. Clark Kent naasis lõpuks Supermeeste valitsemisaja lõpuks ! Kui tema surm tõi DC-sse miljoneid uusi lugejaid, lükkas tagasilöök palju rohkem eemale. Jaemüüja Mile High Comics omanik Chuck Rozanski kirjutas polariseeriva artikli, väites, et Supermani surm ja tagasitulek oli osaliselt vastutav koomiksitööstuse kokkuvarisemise eest 90ndate lõpus.
DC tapaks veel ühe nende peakangelase, osalise tööajaga testpiloodi ja täiskohaga Green Lantern Hal Jordani. 1994. aasta Emerald Twilighti loos läks Jordaania pärast oma linna lammutamist hävitama leina, hävitas Rohelise laterna korpuse. Temast sai supernokk Parallax, suri null tunni sündmuste ajal ja asendati kiiresti noore karikaturisti Kyle Rayneriga. Otsus muuta Green Lantern kurjaks, on endiselt DC üks suuremaid poleemikaid.
Isegi DC suurim sularahalehm Batman vahetati 90ndatel põgusalt välja. Ikoonilises lookaardis Knightfall lõid kirjanikud Chuck Dixon, Doug Moench, Denny O'Neil ja kunstnik Graham Nolan kaabaka, kes oli nii tugev ja kaval, et murda nahkhiir oma luchador-kuriteoülema Bane'iga. Kui Batmani seljaosa paranes, asus kõrgtehnoloogiline Dark Knight korraks Bruce Wayne'i kohale Gothami kaitsja Jean-Pauli orus.
Ehkki paljud on lõbutsenud Valley teravate servadega, kuldses rõhumärkidega nahkhiirte relvastuses, jääb Knightfall üheks DC-i silmapaistvamaks 90-ndate aastate lugudeks ja on Tom Kingi praeguse Batmani loo Bane City aluseks . Mõned Batmani kaasmängijad asendati “moodsate” 90ndate tegelastega, näiteks Cassandra Cain, kes asus Batgirlimantlisse, ja Tim Drake, kes asus Robini rolli (kuigi tehniliselt juhtus see 1989. aasta detsembris).
Superkangelaste koomiksid on olnud kauem kui televisioon ja tõenäoliselt ei kao nad peagi igal ajal. Ehkki 90ndate hirmutasid kirjastajad oma aegumatute märkide asendamist noorte ja teravate Gen-X taaskäivitustega, jäid tegelased lõpuks ellu isegi siis, kui nende korporatiivsed ülemused müüsid ära nende IP-d. Selliste superkangelaste filmide nagu 1998. aasta Blade ja 2000 X-Men edu näitas Hollywoodile, et potentsiaalsed koomiksid on lähtematerjalide kaevanduses. Erinevalt pärismaailmast pole miski koomiksimaailmas kunagi püsiv.
